Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.
File definisi alur kerja di HealthOmics
Anda menggunakan definisi alur kerja untuk menentukan informasi tentang alur kerja, proses, dan tugas dalam proses. Anda membuat definisi alur kerja dalam satu atau beberapa file menggunakan bahasa definisi alur kerja. HealthOmics mendukung definisi alur kerja yang ditulis dalam WDL, Nextflow, atau CWL.
HealthOmics mendukung pilihan berikut untuk definisi alur kerja WDL:
-
WDL - Menyediakan mesin WDL yang sesuai spesifikasi.
-
WDL lunak - Dirancang untuk menangani alur kerja yang dimigrasikan dari Cromwell. Ini mendukung arahan pelanggan Cromwell dan beberapa logika non-kesesuaian. Lihat perinciannya di Konversi tipe implisit di WDL lunak.
Untuk informasi tentang masing-masing bahasa alur kerja, lihat bagian detail khusus bahasa di bawah ini.
Anda menentukan jenis informasi berikut dalam definisi alur kerja:
-
Language version— Bahasa dan versi definisi alur kerja.
-
Compute and memory— Persyaratan komputasi dan memori untuk tugas-tugas dalam alur kerja.
-
Inputs— Lokasi input ke tugas alur kerja. Untuk informasi selengkapnya, lihat HealthOmics jalankan input.
-
Outputs— Lokasi untuk menyimpan output yang dihasilkan tugas.
-
Task resources— Persyaratan komputasi dan memori untuk setiap tugas.
-
Accelerators— sumber daya lain yang dibutuhkan tugas, seperti akselerator.
Topik
