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Rechen- und Speicheranforderungen für HealthOmics Aufgaben
HealthOmics führt Ihre privaten Workflow-Aufgaben in einer Omics-Instanz aus. HealthOmics bietet eine Vielzahl von Instanztypen für verschiedene Arten von Aufgaben. Jeder Instance-Typ hat eine feste Speicher- und vCPU-Konfiguration (und eine feste GPU-Konfiguration für beschleunigte Recheninstanztypen). Die Kosten für die Nutzung einer Omics-Instanz variieren je nach Instanztyp. Einzelheiten finden Sie auf der Seite mit den HealthOmics Preisen
Für Aufgaben in einem Workflow geben Sie den erforderlichen Arbeitsspeicher und v CPUs in der Workflow-Definitionsdatei an. Wenn eine Workflow-Aufgabe ausgeführt wird, HealthOmics ordnet die kleinste Omics-Instanz zu, die den angeforderten Speicher aufnehmen kann, und v. CPUs Wenn eine Aufgabe beispielsweise 64 GiB Speicher und 8 V benötigtCPUs, HealthOmics wählt ausomics.r.2xlarge.
Wir empfehlen Ihnen, die Instance-Typen zu überprüfen und die angeforderte V CPUs - und Speichergröße so einzustellen, dass sie der Instanz entsprechen, die Ihren Anforderungen am besten entspricht. Der Task-Container verwendet die Zahl von v CPUs und die Speichergröße, die Sie in Ihrer Workflow-Definitionsdatei angeben, auch wenn der Instance-Typ über zusätzliche V CPUs und zusätzlichen Speicher verfügt.
Die folgende Liste enthält zusätzliche Informationen zu vCPU und Speicherzuweisung:
Bei der Zuweisung von Container-Ressourcen handelt es sich um feste Grenzwerte. Wenn für eine Aufgabe nicht genügend Arbeitsspeicher zur Verfügung steht oder wenn versucht wird, zusätzliche V zu verwendenCPUs , generiert die Aufgabe ein Fehlerprotokoll und wird beendet.
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Wenn Sie keine Rechen- oder Speicheranforderungen angeben, HealthOmics wählt omics.c.large und verwendet standardmäßig eine Konfiguration mit 1 vCPU und 1 GiB Arbeitsspeicher.
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Die Mindestkonfiguration, die Sie anfordern können, ist 1 vCPU und 1 GiB Arbeitsspeicher.
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Wenn Sie vCPUs, memory oder GPUs that angeben, das die unterstützten Instance-Typen überschreitet, HealthOmics wird eine Fehlermeldung ausgegeben und der Workflow schlägt bei den Validierungen fehl
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Wenn Sie Brucheinheiten angeben, wird auf die nächste HealthOmics Ganzzahl aufgerundet.
HealthOmics reserviert eine kleine Menge an Speicher (5%) für Verwaltungs- und Protokollierungsagenten, sodass der Anwendung in der Aufgabe möglicherweise nicht immer die gesamte Speicherzuweisung zur Verfügung steht.
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HealthOmics passt die Instanztypen an die von Ihnen angegebenen Rechen- und Speicheranforderungen an und verwendet möglicherweise eine Mischung aus Hardwaregenerationen. Aus diesem Grund kann es zu geringfügigen Abweichungen bei den Ausführungszeiten von Aufgaben für dieselbe Aufgabe kommen.
Diese Themen enthalten Einzelheiten zu den HealthOmics unterstützten Instance-Typen.
Themen
Anmerkung
Erhöhen Sie bei standardmäßigen, rechen- und speicheroptimierten Instances die Größe der Instance-Bandbreite, wenn die Instance einen höheren Durchsatz benötigt. Bei EC2 Amazon-Instances mit weniger als 16 v CPUs (Größe 4xl und kleiner) kann es zu Durchsatzsteigerungen kommen. Weitere Informationen zum EC2 Amazon-Instance-Durchsatz finden Sie unter EC2 Verfügbare Instance-Bandbreite von Amazon.
Standard-Instance-Typen
Bei Standard-Instance-Typen zielen die Konfigurationen auf ein ausgewogenes Verhältnis von Rechenleistung und Arbeitsspeicher ab.
HealthOmics unterstützt die Instances 32xlarge und 48xlarge in den folgenden Regionen: USA West (Oregon) und USA Ost (Nord-Virginia).
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher |
|---|---|---|
| omics.m.large | 2 | 8 GiB |
| omics.m.x groß | 4 | 16 GiB |
| omics.m.2 x groß | 8 | 32 GiB |
| omics.m.4xgroß | 16 | 64 GiB |
| omics.m.8xgroß | 32 | 128 GiB |
| omics.m. 12 x groß | 48 | 192 GiB |
| omics.m.16x groß | 64 | 256 GiB |
| omics.m.24x groß | 96 | 384 GiB |
| omics.m.32x groß | 128 | 512 GiB |
| omics.m.48x groß | 192 | 768 GiB |
Für die Datenverarbeitung optimierte Instanzen
Bei rechenoptimierten Instance-Typen verfügen die Konfigurationen über mehr Rechenleistung und weniger Arbeitsspeicher.
HealthOmics unterstützt die Instances 32xlarge und 48xlarge in den folgenden Regionen: USA West (Oregon) und USA Ost (Nord-Virginia).
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher |
|---|---|---|
| omics.c.large | 2 | 4 GiB |
| omics.c.xlarge | 4 | 8 GiB |
| omics.c.2 x groß | 8 | 16 GiB |
| omics.c.4xlarge | 16 | 32 GiB |
| omics.c.8xlarge | 32 | 64 GiB |
| omics.c. 12 x groß | 48 | 96 GiB |
| omics.c. 16 x groß | 64 | 128 GiB |
| omics.c.24xlarge | 96 | 192 GiB |
| omics.c.32xlarge | 128 | 256 GiB |
| omics.c.48xlarge | 192 | 384 GiB |
Speicheroptimierte Instanzen
Bei speicheroptimierten Instance-Typen verfügen die Konfigurationen über weniger Rechenleistung und mehr Arbeitsspeicher.
HealthOmics unterstützt die Instances 32xlarge und 48xlarge in den folgenden Regionen: USA West (Oregon) und USA Ost (Nord-Virginia).
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher |
|---|---|---|
| omics.r.large | 2 | 16 GiB |
| omic s.r.x groß | 4 | 32 GiB |
| omic s.r.2 x groß | 8 | 64 GiB |
| omic s.r.4 x groß | 16 | 128 GiB |
| omic s.r.8 x groß | 32 | 256 GiB |
| omic s.r.12 x groß | 48 | 384 GiB |
| omic s.r.16 x groß | 64 | 512 GiB |
| omic s.r.24 x groß | 96 | 768 GiB |
| omic s.r.32 x groß | 128 | 1024 GiB |
| omic s.r.48 x groß | 192 | 1536 GiB |
Instanzen für beschleunigte Datenverarbeitung
Sie können optional GPU-Ressourcen für jede Aufgabe in einem Workflow angeben, sodass der Aufgabe eine Instanz für HealthOmics beschleunigtes Rechnen zugewiesen wird. Informationen zum Angeben der GPU-Informationen in der Workflow-Definitionsdatei finden Sie unter. Aufgabenbeschleuniger in einer Workflow-Definition HealthOmics
Wenn Sie eine GPU angeben, die mehrere Instanztypen unterstützt, HealthOmics wählt Sie den Instanztyp je nach Verfügbarkeit aus. Wenn beide Instance-Typen verfügbar sind HealthOmics , wird die kostengünstigere Instanz bevorzugt.
G4-Instances werden in der Region Israel (Tel Aviv) nicht unterstützt. G5-Instances werden in der Region Asien-Pazifik (Singapur) nicht unterstützt.
Instance-Typen G6 und G6e
HealthOmics unterstützt die folgenden G6-Instance-Konfigurationen für beschleunigtes Rechnen. Alle omics.g6-Instances verwenden Nvidia L4 oder Nvidia L4 A10G. GPUs
HealthOmics unterstützt die G6- und G6e-Instances in den folgenden Regionen: USA West (Oregon) und USA Ost (Nord-Virginia).
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl von GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g6.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g 6.2 x groß | 8 | 32 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g 6.4x groß | 16 | 64 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g 6.8 x groß | 32 | 128 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g 6.12 x groß | 48 | 192 GiB | 4 | 192 GiB |
| omics.g 6.16x groß | 64 | 256 GiB | 1 | 48 GiB |
| omics.g 6.24x groß | 96 | 192 GiB | 4 | 192 GiB |
Alle omics.g6e-Instanzen verwenden Nvidia L40s. GPUs
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl von GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g6e.xlarge | 4 | 32 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6e.2xlarge | 8 | 64 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6e.4x groß | 16 | 128 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6e.8xgroß | 32 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g6e.12xlarge | 48 | 384 GiB | 4 | 96 GiB |
| omics.g6e.16x groß | 64 | 512 GiB | 1 | 96 GiB |
| omics.g6e.24x groß | 96 | 768 GiB | 4 | 96 GiB |
G4- und G5-Instanzen
HealthOmics unterstützt die folgenden G4- und G5-Instance-Konfigurationen für beschleunigtes Rechnen.
Alle omics.g5-Instances verwenden Nvidia L4 A10G, Nvidia Tesla A10G oder Nvidia Tesla T4 A10G. GPUs
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl von GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g5.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g5.2 x groß | 8 | 32 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g 5.4 x groß | 16 | 64 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g 5.8x groß | 32 | 128 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g 5.12 x groß | 48 | 192 GiB | 4 | 96 GiB |
| omics.g 5.16 x groß | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
| omics.g 5.24x groß | 96 | 384 GiB | 4 | 96 GiB |
Alle omics.g4dn-Instances verwenden Nvidia Tesla T4 oder Nvidia Tesla T4 A10G. GPUs
| Instance | Anzahl von v CPUs | Arbeitsspeicher | Anzahl von GPUs | GPU-Arbeitsspeicher |
|---|---|---|---|---|
| omics.g4dn.xlarge | 4 | 16 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.2xlarge | 8 | 32 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.4xgroß | 16 | 64 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.8xgroß | 32 | 128 GiB | 1 | 16 GiB |
| omics.g4dn.12xlarge | 48 | 192 GiB | 4 | 64 GiB |
| omics.g4dn.16xlarge | 64 | 256 GiB | 1 | 24 GiB |
