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Abfragen von HealthOmics Analysedaten
Wichtig
AWS HealthOmics Variantenspeicher und Annotationsspeicher stehen neuen Kunden nicht mehr zur Verfügung. Vorhandene Kunden können den Service weiterhin wie gewohnt verwenden. Weitere Informationen finden Sie unter AWS HealthOmics Änderung der Verfügbarkeit von Variantenspeicher und Annotationsspeicher.
Sie können Abfragen für Ihre Variantenshops mit AWS Lake Formation Amazon Athena oder Amazon EMR durchführen. Bevor Sie Abfragen ausführen, müssen Sie die (in den folgenden Abschnitten beschriebenen) Einrichtungsverfahren für Lake Formation und Amazon Athena abschließen.
Informationen zu Amazon EMR finden Sie unter Tutorial: Erste Schritte mit Amazon EMR
HealthOmics Partitionieren Sie bei Variantenspeichern, die nach dem 26. September 2024 erstellt wurden, den Speicher nach der Proben-ID. Diese Partitionierung bedeutet, dass die Proben-ID HealthOmics verwendet wird, um die Speicherung der Varianteninformationen zu optimieren. Abfragen, die Probeninformationen als Filter verwenden, geben schneller Ergebnisse zurück, da die Abfrage weniger Daten scannt.
HealthOmics verwendet Beispiel IDs als Partitionsdateinamen. Bevor Sie Daten aufnehmen, überprüfen Sie, ob die Proben-ID PHI-Daten enthält. Ist dies der Fall, ändern Sie die Proben-ID, bevor Sie die Daten aufnehmen. Weitere Informationen darüber, welche Inhalte in die Stichprobe aufgenommen werden sollen und welche nicht IDs, finden Sie in den Anleitungen auf der Webseite zur AWS HIPAA-Konformität
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