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生命科學資料收集、儲存和處理
發佈日期:2022 年 7 月 20 日 (圖表歷史記錄)
此架構圖可協助您了解如何將生命科學資料檔案傳輸至雲端,並使用 Amazon Web Services () 提供資料存取AWS。
生命科學資料收集、儲存和處理圖表
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實驗室技術人員會執行實驗,並將結果寫入現場部署檔案伺服器上的資料夾。 AWS DataSync 任務設定為將資料從本機儲存同步到 Amazon Simple Storage Service (Amazon S3) 中的儲存貯體。
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資料會透過 AWS 雲端 網際網路或透過避免網際網路的低延遲直接連線傳輸到 ,例如 AWS Direct Connect。
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現場部署研究人員透過 Amazon S3 檔案閘道使用網路檔案系統 (NFS) 或伺服器訊息區塊 (SMB),在現有的生物資訊工具中分析 Amazon S3 中的資料。
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與合約研究組織 (CRO) 等實體合作,可以使用 AWS Transfer Family for FTP、SFTP 或 FTPS 將試驗結果上傳至 Amazon S3。
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您可以將執行資料的工具寫入設定為不常存取的 S3 儲存貯體,以最佳化儲存體。識別您的 S3 儲存體存取模式,以最佳方式設定 S3 儲存貯體生命週期政策,並將資料傳輸至其中 Amazon Glacier。
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使用 Amazon FSx for Lustre,資料可供 雲端上的高效能運算 (HPC) 存取,用於基因體、影像和其他密集工作負載,以提供低毫秒延遲的共用檔案系統。
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使用 AWS Step Functions 和 在雲端上協調研究 HPC 工作負載 AWS Batch,以便在 Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2) 執行個體或 Amazon Elastic Container Service (Amazon ECS) 容器上進行靈活的中央處理單元 (CPU) 和圖形處理單元 (GPU) 運算。
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機器學習使用常見的人工智慧和機器學習 (AI/ML) 工具組執行,該工具組使用 Amazon SageMaker AI 進行特徵工程、資料標記、模型訓練、部署和 ML 操作。Amazon Athena 用於具有現有工具的彈性 SQL 查詢。
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| 變更 | 描述 | 日期 |
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初次出版 | 首先發佈參考架構圖。 | 2022 年 7 月 20 日 |
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