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生命科学数据收集、存储和处理
发布日期:2022年 7月20日 (图表历史)
此架构图可帮助您学习如何将生命科学数据文件传输到云端,以及如何使用亚马逊网络服务 (AWS) 提供数据访问权限。
生命科学数据收集、存储和处理图
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实验室技术人员运行实验,结果写入本地文件服务器上的文件夹。设置了一项 AWS DataSync 任务,将数据从本地存储同步到亚马逊简单存储服务 (Amazon S3) 中的存储桶。
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数据要 AWS Cloud 么通过互联网传输,要么通过避开互联网的低延迟直接连接传输到,例如。 AWS Direct Connect
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On-premises 研究人员通过亚马逊 S3 文件网关使用网络文件系统 (NFS) 或服务器消息块 (SMB) 在现有生物信息学工具中分析亚马逊 S3 中的数据。
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合同研究组织 (CRO) 等合作实体可以通过使用 AWS Transfer Family FTP、SFTP 或 FTPS 将研究结果上传到亚马逊 S3。
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您可以通过编写将数据运行到配置为不经常访问的 S3 存储桶的工具来优化存储。确定您的 S3 存储访问模式,以最佳方式配置 S3 存储桶生命周期策略并将数据传输到 Amazon Glacier。
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使用 Amazon FSx for Lustre,可以在云端进行高性能计算 (HPC) 访问数据,用于基因组学、成像和其他密集型工作负载,从而提供低毫秒延迟的共享文件系统。
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研究 HPC 工作负载使用 AWS Step Functions 和在云端编排 AWS Batch,用于在亚马逊弹性计算云 (Amazon EC2) 实例或亚马逊弹性容器服务 (Amazon ECS) 容器上进行灵活的中央处理单元 (CPU) 和图形处理单元 (GPU) 计算。
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机器学习使用通用的人工智能和机器学习 (AI/ML) 工具包进行,该工具包使用 SageMaker Amazon AI 进行功能工程、数据标签、模型训练、部署和机器学习操作。亚马逊雅典娜用于使用现有工具进行灵活的 SQL 查询。
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| 变更 | 说明 | 日期 |
|---|---|---|
初次发布 | 参考架构图首次发布。 | 2022 年 7 月 20 日 |
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