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생명과학 데이터 수집, 저장 및 처리
게시일: 2022년 7월 20일(다이어그램 기록)
이 아키텍처 다이어그램은 Amazon Web Services()를 사용하여 생명과학 데이터 파일을 클라우드로 전송하고 데이터 액세스를 제공하는 방법을 학습하는 데 도움이 됩니다AWS.
생명 과학 데이터 수집, 저장 및 처리 다이어그램
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랩 기술자가 실험을 실행하면 결과가 온프레미스 파일 서버의 폴더에 기록됩니다. 로컬 스토리지의 데이터를 Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)의 버킷에 동기화하도록 AWS DataSync 작업이 설정됩니다.
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데이터는 인터넷을 AWS 클라우드 통해 또는와 같이 인터넷을 방지하는 지연 시간이 짧은 직접 연결을 통해 로 전송됩니다 AWS Direct Connect.
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온프레미스 연구원은 Amazon S3 File Gateway를 통해 NFS(Network File System) 또는 SMB(Server Message Block)를 사용하여 기존 생물 정보학 도구에서 Amazon S3의 데이터를 분석합니다.
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CRO(계약 연구 조직)와 같은 파트너 엔터티는 FTP, SFTP 또는 FTPS AWS Transfer Family 에를 사용하여 Amazon S3에 연구 결과를 업로드할 수 있습니다.
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자주 액세스하지 않도록 구성된 S3 버킷에 데이터를 실행하는 도구를 작성하여 스토리지를 최적화할 수 있습니다. S3 버킷 수명 주기 정책을 최적으로 구성하고 데이터를 전송할 S3 스토리지 액세스 패턴을 식별합니다 Amazon Glacier.
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Amazon FSx for Lustre를 사용하면 게놈학, 이미징 및 기타 집약적인 워크로드를 위해 클라우드의 고성능 컴퓨팅(HPC)에 데이터에 액세스하여 밀리초 미만의 지연 시간을 제공하는 공유 파일 시스템을 제공할 수 있습니다.
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연구 HPC 워크로드는 Amazon Elastic Compute Cloud(Amazon EC2) 인스턴스 또는 Amazon Elastic Container Service(Amazon ECS) 컨테이너에서 유연한 중앙 처리 장치(CPU) 및 그래픽 처리 장치(GPU) 컴퓨팅 AWS Batch을 위해 AWS Step Functions 및를 사용하여 클라우드에서 오케스트레이션됩니다.
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기계 학습은 특성 엔지니어링, 데이터 레이블 지정, 모델 훈련, 배포 및 ML 작업에 Amazon SageMaker AI를 사용하는 일반적인 인공 지능 및 기계 학습(AI/ML) 툴킷을 사용하여 수행됩니다. Amazon Athena는 기존 도구를 사용하는 유연한 SQL 쿼리에 사용됩니다.
참조 자료
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다이어그램 기록
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최초 게시 | 참조 아키텍처 다이어그램이 처음 게시되었습니다. | 2022년 7월 20일 |
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