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HealthOmics의 워크플로 정의 파일
워크플로 정의를 사용하여 워크플로, 실행 및 실행의 작업에 대한 정보를 지정합니다. 워크플로 정의 언어를 사용하여 하나 이상의 파일에 워크플로 정의를 생성합니다. HealthOmics는 WDL, Nextflow 또는 CWL로 작성된 워크플로 정의를 지원합니다.
HealthOmics는 WDL 워크플로 정의에 대해 다음과 같은 선택을 지원합니다.
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WDL - 사양을 준수하는 WDL 엔진을 제공합니다.
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WDL lenient - Cromwell에서 마이그레이션된 워크플로를 처리하도록 설계되었습니다. 고객 Cromwell 지시문과 일부 규정 미준수 로직을 지원합니다. 자세한 내용은 WDL lenient의 암시적 유형 변환을 참조하세요.
각 워크플로 언어에 대한 자세한 내용은 아래의 언어별 세부 섹션을 참조하세요.
워크플로 정의에서 다음과 같은 유형의 정보를 지정합니다.
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Language version - 워크플로 정의의 언어 및 버전입니다.
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Compute and memory - 워크플로의 작업에 대한 컴퓨팅 및 메모리 요구 사항입니다.
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Inputs - 워크플로 작업에 대한 입력의 위치입니다. 자세한 내용은 HealthOmics 실행 입력 단원을 참조하십시오.
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Outputs - 작업이 생성하는 출력을 저장할 위치입니다.
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Task resources - 각 작업에 대한 컴퓨팅 및 메모리 요구 사항입니다.
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Accelerators - 액셀러레이터와 같이 작업에 필요한 기타 리소스.
주제
