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HealthOmics 分析データのクエリ
重要
AWS HealthOmics バリアントストアと注釈ストアは、新規のお客様に公開されなくなりました。既存のお客様は、通常どおりサービスを引き続き使用できます。詳細については、「AWS HealthOmics バリアントストアと注釈ストアの可用性の変更」を参照してください。
バリアントストアでクエリを実行するには、 AWS Lake Formation と Amazon Athena または Amazon EMR を使用します。クエリを実行する前に、Lake Formation と Amazon Athena のセットアップ手順 (以下のセクションで説明) を完了してください。
Amazon EMR の詳細については、「チュートリアル: Amazon EMR の開始方法」を参照してください。
2024 年 9 月 26 日以降に作成されたバリアントストアの場合、HealthOmics はストアをサンプル ID でパーティション分割します。このパーティショニングは、HealthOmics がサンプル ID を使用してバリアント情報の保存を最適化することを意味します。サンプル情報をフィルターとして使用するクエリは、クエリがスキャンするデータが少ないため、より迅速に結果を返します。
HealthOmics はパーティションファイル名としてサンプル IDsを使用します。データを取り込む前に、サンプル ID に PHI データが含まれているかどうかを確認します。その場合は、データを取り込む前にサンプル ID を変更します。サンプル IDs に含めるコンテンツと含めないコンテンツの詳細については、 AWS HIPAA コンプライアンス
