Jalankan kembali lari HealthOmics - AWS HealthOmics
Jalankan kembali proses menggunakan konsolJalankan kembali proses menggunakan APIMenggunakan alat Rerun

Terjemahan disediakan oleh mesin penerjemah. Jika konten terjemahan yang diberikan bertentangan dengan versi bahasa Inggris aslinya, utamakan versi bahasa Inggris.

Jalankan kembali lari HealthOmics

Untuk proses yang belum Anda hapus, gunakan konsol atau API untuk menjalankan kembali proses. Untuk menjalankan yang Anda hapus, gunakan alat ini. HealthOmics rerun

Jalankan kembali proses menggunakan konsol

Dari konsol, ikuti langkah-langkah ini untuk menjalankan kembali proses:

  1. Buka konsol HealthOmics .

  2. Jika diperlukan, buka panel navigasi kiri (≡). Pilih Runs.

  3. Pada halaman Runs, pilih run untuk dijalankan kembali.

  4. Dari menu tindakan di atas tabel, pilih Re-run.

Jalankan kembali proses menggunakan API

Gunakan operasi StartRun API untuk menjalankan kembali proses yang sudah ada. Berikan masukan yang diperlukan berikut:

  • Peran layanan ARN ()roleArn.

  • ID dari run ke duplikat (runId).

  • Lokasi Amazon S3 tempat proses menyimpan output run (). outputUri

aws omics start-run 
     --run-id run id \
     --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
     --output-uri s3://workflow-output-b6f2fce1

Menggunakan alat Rerun

Untuk proses yang dihapus, Anda dapat mengunduh dan menggunakan HealthOmics rerun alat untuk menjalankan kembali proses. Alat ini mengambil informasi yang dijalankan dari manifes CloudWatch Log. Unduh rerun alat dari GitHub repositori HealthOmics Alat.

Contoh berikut menunjukkan cara menggunakan rerun alat ini.

aws-healthomics-rerun 9876543

Jika run ada di CloudWatch, Anda menerima respons yang mirip dengan contoh output berikut. Jika alur kerja tidak ada lagi, Anda menerima pesan galat.

Original request:
{
  "workflowId": "9679729",
  "roleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/DemoRole",
  "name": "sample_rerun",
  "parameters": {
    "image": "123456789012.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/default:latest",
    "file1": "omics://123456789012.storage.us-west-2.amazonaws.com/8647780323/readSet/6389608538"
  },
  "outputUri": "s3://workflow-output-bcf2fcb1"
}
StartRun request:
{
  "workflowId": "9679729",
  "roleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/DemoRole",
  "name": "new test",
  "parameters": {
    "image": "123456789012.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/default:latest",
    "file1": "omics://123456789012.storage.us-west-2.amazonaws.com/8647780323/readSet/6389608538"
  },
  "outputUri": "s3://workflow-output-bcf2fcb1"
}
StartRun response:
{
  "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/9171779",
  "id": "9171779",
  "status": "PENDING",
  "tags": {}
}