Memulai HealthOmics alur kerja Ready2Run menggunakan API

Sebagian besar operasi API berperilaku serupa untuk alur kerja Ready2Run dan alur kerja pribadi.

Untuk mengembalikan daftar alur kerja Ready2Run yang tersedia, gunakan daftar-alur kerja dengan parameter yang disetel ke RUN. type READY2

aws omics list-workflows --type READY2RUN                            

Setelah mengidentifikasi alur kerja yang akan dijalankan dari respons list-alur kerja, Anda dapat menggunakan get-workflow dengan parameter untuk mendapatkan detail selengkapnya. --id

aws omics get-workflow --type READY2RUN --id workflow id    

Untuk menjalankan alur kerja Ready2Run, Anda dapat menggunakan operasi API start-run dengan parameter tipe alur kerja yang disetel ke, seperti yang ditunjukkan pada contoh berikut READY2RUN

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \
  --workflow-id workflow id \
  --output-uri &example-s3-bucket; \
  --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
  --parameters file:///path/to/parameters.json

Untuk menentukan versi alur kerja, gunakan parameter versi alur kerja, seperti yang ditunjukkan dalam contoh ini.

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \ 
  ...
  --version-name '3.0.0'

Untuk memantau proses Anda, Anda dapat menggunakan operasi get-run API, seperti yang ditunjukkan.

aws-omics get-run \
  --id run id