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Interrogation de HealthOmics données analytiques
Important
AWS HealthOmics les magasins de variantes et les magasins d'annotations ne sont plus ouverts aux nouveaux clients. Les clients existants peuvent continuer à utiliser le service normalement. Pour de plus amples informations, veuillez consulter AWS HealthOmics modification de la disponibilité du magasin de variantes et du magasin d'annotations.
Vous pouvez effectuer des requêtes sur vos variantes de boutiques à l'aide AWS Lake Formation d'Amazon Athena ou d'Amazon EMR. Avant d'exécuter des requêtes, suivez les procédures de configuration (décrites dans les sections suivantes) pour Lake Formation et Amazon Athena.
Pour plus d'informations sur Amazon EMR, consultez Tutoriel : Commencer à utiliser Amazon EMR
Pour les variantes de magasins créées après le 26 septembre 2024, HealthOmics partitionnez le magasin par ID d'échantillon. Ce partitionnement signifie qu'il HealthOmics utilise l'identifiant de l'échantillon pour optimiser le stockage des informations sur les variantes. Les requêtes qui utilisent des exemples d'informations comme filtres renvoient des résultats plus rapidement, car elles analysent moins de données.
HealthOmics utilise un échantillon IDs comme nom de fichier de partition. Avant d'ingérer des données, vérifiez si l'identifiant d'échantillon contient des données PHI. Si c'est le cas, modifiez l'identifiant de l'échantillon avant d'ingérer les données. Pour plus d'informations sur le contenu à inclure et à ne pas inclure dans l'échantillon IDs, consultez les instructions sur la page Web de conformité à la loi AWS HIPAA
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