Workflows Ready2Run dans HealthOmics - AWS HealthOmics

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Workflows Ready2Run dans HealthOmics

Les flux de travail Ready2Run sont des flux de travail préconfigurés publiés par des éditeurs tiers. Certains éditeurs, tels que Sentieon Inc, proposent des flux de travail basés sur des abonnements. Les autres flux de travail Ready2Run ne nécessitent pas d'abonnement, et certains flux de travail sont open source, tels que les flux de travail NF-Core.

Les flux de travail Ready2Run sont parfaitement adaptés aux scénarios suivants :

  • Vous souhaitez vous concentrer sur l'analyse de la sortie du pipeline et sur la génération de résultats, sans avoir à configurer l'infrastructure sous-jacente.

  • Vous souhaitez reproduire vos résultats à l'aide de flux de travail établis.

  • En tant que développeur de logiciels, vous souhaitez intégrer votre application directement au HealthOmics SDK.

HealthOmics prend en charge la gestion des versions pour les flux de travail Ready2Run. Pour un flux de travail Ready2Run proposant des versions, vous pouvez spécifier le nom de la version lorsque vous démarrez une exécution.

Tous les flux de travail Ready2Run fournissent des journaux, y compris CloudWatch des journaux, que vous pouvez utiliser pour le dépannage.

Note

Les flux de travail Sentieon Ready2Run sont basés sur un abonnement. Lorsque vous exécutez un flux de travail Sentieon Ready2Run pour la première fois dans un compte, Sentieon crée automatiquement une licence d'évaluation de deux semaines pour votre. Compte AWS La licence est valide pour tous les flux de travail Sentieon Ready2Run. Une fois la période d'évaluation terminée, vous pouvez demander une licence permanente ou une extension de la licence d'évaluation. Consultez Subscribing to Sentieon Ready2Run workflows pour plus de détails.