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Consulta de datos HealthOmics analíticos
importante
AWS HealthOmics las tiendas de variantes y las tiendas de anotaciones ya no están abiertas a nuevos clientes. Los clientes existentes pueden seguir utilizando el servicio con normalidad. Para obtener más información, consulte AWS HealthOmics cambio en la disponibilidad del almacén de variantes y del almacén de anotaciones.
Puede realizar consultas en sus tiendas de variantes mediante AWS Lake Formation Amazon Athena o Amazon EMR. Antes de ejecutar cualquier consulta, complete los procedimientos de configuración (descritos en las siguientes secciones) para Lake Formation y Amazon Athena.
Para obtener información sobre Amazon EMR, consulte el tutorial: Introducción a Amazon EMR
En el caso de las tiendas de variantes creadas después del 26 de septiembre de 2024, HealthOmics divida la tienda por ID de muestra. Esta partición significa que HealthOmics utiliza el ID de muestra para optimizar el almacenamiento de la información de la variante. Las consultas que utilizan información de muestra como filtros devolverán los resultados más rápido, ya que la consulta escanea menos datos.
HealthOmics utiliza muestras IDs como nombres de archivos de partición. Antes de ingerir datos, compruebe si el ID de muestra contiene algún dato de PHI. Si es así, cambie la ID de la muestra antes de ingerir los datos. Para obtener más información sobre qué contenido incluir y qué no incluir en la muestra IDs, consulte la guía en la página web sobre el cumplimiento de la AWS HIPAA
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