在 HealthOmics 中重新執行執行 - AWS HealthOmics
使用主控台重新執行執行使用 API 重新執行執行使用重新執行工具

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在 HealthOmics 中重新執行執行

對於您尚未刪除的執行，請使用 主控台或 API 重新執行執行。對於您已刪除的執行，請使用 HealthOmics rerun工具。

使用主控台重新執行執行

從 主控台，依照下列步驟重新執行執行：

  1. 開啟 HealthOmics 主控台。

  2. 如有需要，請開啟左側導覽窗格 (≡)。選擇執行。

  3. 在執行頁面上，選取要重新執行的執行。

  4. 從資料表上方的動作功能表中，選擇重新執行。

使用 API 重新執行執行

使用 StartRun API 操作重新執行現有的執行。提供下列必要輸入：

  • 服務角色 ARN (roleArn)。

  • 要複製的執行 ID (runId)。

  • 執行儲存執行輸出的 Amazon S3 位置 (outputUri)。

aws omics start-run 
     --run-id run id \
     --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
     --output-uri s3://workflow-output-b6f2fce1

使用重新執行工具

對於已刪除的執行，您可以下載並使用 HealthOmics rerun工具來重新執行執行。工具會從 CloudWatch Logs 資訊清單中擷取執行資訊。從 HealthOmics Tool GitHub 儲存庫下載rerun工具。

下列範例示範如何使用 rerun工具。

aws-healthomics-rerun 9876543

如果執行存在於 CloudWatch 中，您會收到類似下列範例輸出的回應。如果工作流程不再存在，您會收到錯誤訊息。

Original request:
{
  "workflowId": "9679729",
  "roleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/DemoRole",
  "name": "sample_rerun",
  "parameters": {
    "image": "123456789012.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/default:latest",
    "file1": "omics://123456789012.storage.us-west-2.amazonaws.com/8647780323/readSet/6389608538"
  },
  "outputUri": "s3://workflow-output-bcf2fcb1"
}
StartRun request:
{
  "workflowId": "9679729",
  "roleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/DemoRole",
  "name": "new test",
  "parameters": {
    "image": "123456789012.dkr.ecr.us-west-2.amazonaws.com/default:latest",
    "file1": "omics://123456789012.storage.us-west-2.amazonaws.com/8647780323/readSet/6389608538"
  },
  "outputUri": "s3://workflow-output-bcf2fcb1"
}
StartRun response:
{
  "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/9171779",
  "id": "9171779",
  "status": "PENDING",
  "tags": {}
}