使用 API 啟動 HealthOmics Ready2Run 工作流程 - AWS HealthOmics

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使用 API 啟動 HealthOmics Ready2Run 工作流程

大多數 API 操作的行為方式與 Ready2Run 工作流程和私有工作流程類似。

若要傳回可用的 Ready2Run 工作流程清單，請使用將 type 參數設為 READY2RUN 的 list-workflows。

aws omics list-workflows --type READY2RUN

在您識別要從 list-workflows 回應執行的工作流程之後，您可以使用 get-workflow 搭配 --id 參數來取得更多詳細資訊。

aws omics get-workflow --type READY2RUN --id workflow id

若要執行 Ready2Run 工作流程，您可以使用 start-run API 操作，並將工作流程類型參數設為 READY2RUN，如下列範例所示

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \
  --workflow-id workflow id \
  --output-uri &example-s3-bucket; \
  --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
  --parameters file:///path/to/parameters.json

若要指定工作流程版本，請使用 workflow-version 參數，如本範例所示。

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \ 
  ...
  --version-name '3.0.0'

若要監控您的執行，您可以使用 get-run API 操作，如下所示。

aws-omics get-run \
  --id run id