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EventBridge 与一起使用 AWS HealthOmics
HealthOmics EventBridge 当资源状态发生变化时,向 Amazon 发送事件。资源包括导入任务、导出任务、资源共享、工作流程、任务和运行。对于每种类型的资源,都有一个生成事件的状态更改列表。
事件总线是接收事件并将其传送到目的地的路由器。您的账户包含一个默认事件总线,该总线可自动接收来自 AWS 服务的事件。您可以创建其他自定义事件总线。
您可以创建 EventBridge 规则来指定事件总线接收事件时要采取的操作。例如,您可以创建一条规则,通知您有关资源状态变化的信息。
使用事件的常见场景包括:
-
监控用户何时与您共享资源或撤消共享。
-
监视运行是失败还是成功完成。
有关使用的更多信息 EventBridge,请参阅 Amazon 是什么 EventBridge?
设置 EventBridge 为 HealthOmics
在监控 EventBridge 事件之前,请先创建 EventBridge 总线并为感兴趣的事件创建规则。
配置总 EventBridge 线
您可以为自己使用默认事件总线, AWS 账户 也可以配置自定义事件总线。要配置自定义事件总线,请执行以下步骤:
-
打开 EventBridge 控制台:https://console.aws.amazon.com/events/
. -
在左侧导航栏中,选择事件总线。
-
选择 Create event bus (创建事件总线)。
-
在创建事件总线窗体中,输入总线的名称。
-
选择 “创建” 以创建总线。
创建 EventBridge 规则
以下过程说明如何创建简单规则。有关规则的更多信息,请参阅中的规则 EventBridge。
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打开 EventBridge 控制台:https://console.aws.amazon.com/events/
. -
在左侧导航窗格中,选择 Rules。
-
选择创建规则。控制台打开 “创建规则” 表单。
-
在定义规则详细信息中,提供规则的名称。
在名称中,输入总线的名称。
对于事件总线,请为该规则选择总线。
选择下一步。
-
在构建事件模式中,在事件源下选择 AWS 事件或 EventBridge 合作伙伴事件。
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向下滚动到事件模式。
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对于事件源,请选择 AWS 服务。
-
对于 AWS 服务,请在文本筛选器中输入 omics,然后选择AWS HealthOmics作为服务。
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对于事件类型,选择感兴趣的事件(或所有事件)。
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选择下一步。
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-
在选择目标中,为事件选择一个目标。例如,选择 AWS 服务,选择CloudWatch 日志组,然后配置日志组。
对于许多目标类型, EventBridge 需要权限将事件发送到目标。控制台会为您创建这些权限。
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(可选)在配置标签中,将标签与规则关联。
-
在查看和更新中,查看配置并选择创建规则。
EventBridge 中的事件 HealthOmics
下表列出了 HealthOmics 发送到 EventBridge的事件以及该事件的可能状态值列表。
事件名称 | 可能的状态值 |
---|---|
注释导入 Job 状态更改 | 已提交、进行中、已取消、已完成、失败或已完成但失败 |
注释存储共享状态变更 | 待处理、激活、激活、删除、已删除、失败 |
注释存储状态变更 | 创建、创建、更新、更新、删除、删除或创建失败 |
已阅读 “设置激活 Job 状态更改” | 已提交、进行中、已完成、失败或已完成但失败 |
已读取设置导出 Job 状态更改 | 已提交、进行中、已完成、失败或已完成但失败 |
读取设置导入 Job 状态更改 | 已提交、进行中、已完成、失败或已完成但失败 |
已阅读 “设置状态更改” | 正在处理上传、上传失败、激活、已存档、激活或已删除 |
参考导入 Job 状态更改 | 已提交、进行中、已完成、失败或已完成但失败 |
参考状态变更 | 已激活或已删除 |
参考商店状态变更 | 已创建、更新、活动或已删除 |
运行状态更改 | 待处理、正在启动、正在运行、正在停止、已完成、已删除、失败或已取消 |
序列存储状态更改 | 已创建、更新、活动或已删除 |
任务状态更改 | 待处理、正在启动、正在运行、正在停止、已完成、已删除、失败或已取消 |
变体导入 Job 状态更改 | 已提交、进行中、已取消、已完成、失败或已完成但失败 |
变体商店共享状态变更 | 待处理、激活、激活、删除、已删除、失败 |
变体商店状态变更 | 创建、创建、更新、更新、删除、删除或创建失败 |
工作流程共享状态更改 | 待处理、激活、激活、删除、已删除、失败 |
工作流程状态变更 | 创建成功、创建失败、删除成功或删除失败 |
事件消息结构
HealthOmics 提供尽力交付以向其发送状态更改事件消息 EventBridge。该事件是一个具有 JSON 结构的对象,其中还包含元数据详细信息。您可以使用元数据作为输入来重新创建事件或了解更多信息。事件包括以下字段:
-
version
— 目前所有事件均为 0(零)。 -
id
— 为每个事件生成的版本 4 UUID。 -
detail-type
— 正在发送的事件类型。 -
account
— 存储桶所有者的 12 位 AWS 账户 ID。 -
source
— 标识生成事件的服务。 -
time
— 事件发生的时间。 -
region
— 标 AWS 区域 识存储桶的。 -
resources
— 包含存储桶的亚马逊资源名称 (ARN) 的 JSON 数组。 -
detail
— 包含事件相关信息的 JSON 对象。
运行事件包括以下字段:
-
uuid
— 运行的通用唯一标识符。 -
workflowId
— 与此运行关联的工作流程的工作流程标识符。 -
workflowName
— 与此运行关联的工作流程的名称。 -
runId
— 运行标识符。 -
runName
— 运行名称。 -
runOutputUri
— 运行将写入其输出数据的 URI。
事件消息示例
以下示例是运行状态更改的事件,显示了其他字段。
{ "version":"0", "id":"c0e540f4-df38-b986-86c1-3e3730f971fe", "detail-type":"Run Status Change", "source":"aws.omics", "account":"123456789012", "time":"2022-10-20T22:07:35Z", "region":"us-west-2", "resources":[ "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/2101313" ], "detail":{ "omicsVersion":"1.0.0", "arn":"arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/2101313", "status":"COMPLETED", "uuid":"153893cd-097a-40ec-aec7-838a97cd2b21", "runId": "1234567", "runName": "run name", "runOutputUri": "s3://amzn-s3-demo-bucket/run-output/2101313", "workflowId": "1234567", "workflowName": "workflow name" } }
以下示例是任务状态更改的事件。
{ "version": "0", "id": "718d6817-c868-26d3-8ef0-0dc9b2ac73f4", "detail-type": "Task Status Change", "source": "aws.omics", "account": "123456789012", "time": "2024-10-30T09:05:44Z", "region": "us-west-2", "resources": ["arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:task/8888888"], "detail": { "omicsVersion": "1.0.0", "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:task/8888888", "status": "COMPLETED", "runArn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:run/2101313", "runUuid": "153893cd-097a-40ec-aec7-838a97cd2b21", "runId": "1234567", "runName": "run name", "workflowId": "1234567", "workflowName": "workflow name" } }
以下是读取集状态更改事件的示例。
{ "version": "0", "id": "64ca0eda-9751-dc55-c41a-1bd50b4fc9b7", "detail-type": "Read Set Status Change", "source": "aws.omics", "account": "123456789012", "time": "2023-04-04T17:53:06Z", "region": "us-west-2", "resources": ["arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:sequenceStore/1234567890/readSet/3456789012"], "detail": { "omicsVersion": "1.0.0", "arn": "arn:aws:omics:us-west-2:123456789012:sequenceStore/1234567890/readSet/3456789012", "sequenceStoreId" : "1234567890", "id": "3456789012", "status": "PROCESSING_UPLOAD" } }
将为变体商店导入任务创建类似的事件。
{ "version": "0", "id": "6a7e8feb-b491-4cf7-a9f1-bf3703467718", "detail-type": "Variant Store Status Change", "source": "aws.omics", "account": "123456789012", "time": "2015-12-22T18:43:48Z", "region": "us-east-1", "resources": ["arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:myvariantstore2"], "detail": { "omicsVersion": "1.0.0", "arn": "arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:myvariantstore2", "status": "CREATED", "storeId": "6710c5f02610", "storeName": "myvariantstore2" } }
以下是导入任务状态变更的事件。
{ "version": "0", "id": "6a7e8feb-b491-4cf7-a9f1-bf3703467718", "detail-type": "Variant Import Job Status Change", "source": "aws.omics", "account": "123456789012", "time": "2015-12-22T18:43:48Z", "region": "us-east-1", "resources": ["arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:my_variant_store/b64ea9a3-459f-4b68-92c3-3ddb83209fe9"], "detail": { "omicsVersion": "1.0.0", "arn": "arn:aws:omics:us-east-1:123456789012:my_variant_store/b64ea9a3-459f-4b68-92c3-3ddb83209fe9", "status": "COMPLETED", "jobId": "b64ea9a3-459f-4b68-92c3-3ddb83209fe9", "storeId": "a74869f91e20", "storeName": "my_variant_store" } }