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# 创建 HealthOmics 注释存储库
<a name="creating-and-managing-annotation-store"></a>

**重要**  
AWS HealthOmics 变体存储和注释存储不再向新客户开放。现有客户可以继续正常使用该服务。有关更多信息，请参阅 [AWS HealthOmics 变体存储和注释存储库可用性变更](variant-store-availability-change.md)。

注释存储是表示注释数据库的数据存储，例如来自 TSV、VCF 或 GFF 文件的注释数据库。如果指定了相同的参考基因组，则在导入过程中，注释存储将映射到与变体存储相同的坐标系。以下主题介绍如何使用 HealthOmics 控制台以及 AWS CLI 如何创建和管理注释存储库。

**Topics**
+ [使用控制台创建注释存储库](#gs-console-create-annotation-store)
+ [使用 API 创建注释存储库](#create-manage-annotation-store-api)

## 使用控制台创建注释存储库
<a name="gs-console-create-annotation-store"></a>

使用以下步骤通过 HealthOmics 控制台创建注释存储库。

**创建注释存储库**

1. 打开 [HealthOmics 控制台](https://console.aws.amazon.com/omics/)。

1.  如果需要，请打开左侧导航窗格 (►)。选择 “**注释存储**”。

1. 在**注释存储**页面上，选择**创建注释存储**。

1. 在**创建注释存储**页面上，提供以下信息
   + **注释商店名称**-此商店的唯一名称。
   + **描述**（可选）-此参考基因组的描述。
   + **数据格式和架构详细信息**-选择数据文件格式并上传此存储的架构定义。
   + **参考基因组**-此注释的参考基因组。
   + **数据加密**-选择是希望数据加密由 AWS 自己拥有和管理。
   + **标签**（可选）-为此注释存储库提供最多 50 个标签。

1. 选择 “**创建注释存储”**。

## 使用 API 创建注释存储库
<a name="create-manage-annotation-store-api"></a>

以下示例说明如何使用创建注释存储库 AWS CLI。对于所有操作 AWS CLI 和 API 操作，您必须指定数据的格式。

```
aws omics create-annotation-store --name my_annotation_store \
           --store-format GFF \
           --reference referenceArn="arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/6505293348/reference/5987565360"
           --version-name new_version
```

您会收到以下回复，以确认您的注释存储库已创建。

```
{
           "creationTime": "2022-08-24T20:34:19.229500Z",
           "id": "3b93cdef69d2",
           "name": "my_annotation_store",
           "reference": {
               "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/6505293348/reference/5987565360"
           },
           "status": "CREATING"
           "versionName": "my_version"
       }
```

要了解有关注释存储的更多信息，请使用 **get-annotation-store**API。

```
aws omics get-annotation-store --name my_annotation_store
```

您会收到以下回复。

```
{
          "id": "eeb019ac79c2",
          "reference": {
              "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/5638433913/reference/5871590330“
          },
          "status": "ACTIVE",
          "storeArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:annotationStore/gffstore",
          "name": "my_annotation_store",
          "creationTime": "2022-11-05T00:05:19.136131+00:00",
          "updateTime": "2022-11-05T00:10:36.944839+00:00",
          "tags": {},
          "storeFormat": "GFF",
          "statusMessage": "",
          "storeSizeBytes": 0,
          "numVersions": 1
      }
```

要查看与账户关联的所有注释库，请使用 **list-annotation-stores**API 操作。

```
aws omics list-annotation-stores 
```

您会收到一个列出所有注释库及其 IDs状态和其他详细信息的响应，如以下示例响应所示。

```
{
           "annotationStores": [
               {
                  "id": "4d8f3eada259",
                   "reference":
                       "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/5638433913/reference/5871590330"
                   },
                   "status": "CREATING",
                   "name": "gffstore",
                   "creationTime": "2022-09-27T17:30:52.182990+00:00",
                   "updateTime": "2022-09-27T17:30:53.025362+00:00"
               }
           ]
       }
```

您也可以根据状态或其他条件筛选回复。