使用 API 启动 HealthOmics Ready2Run 工作流程 - AWS HealthOmics

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使用 API 启动 HealthOmics Ready2Run 工作流程

对于 Ready2Run 工作流程和私有工作流程，大多数 API 操作的行为方式类似。

要返回可用的 Ready2Run 工作流程列表，请使用参数设置为 RUN 的type列表工作流程。 READY2

aws omics list-workflows --type READY2RUN

从列表工作流响应中确定要运行的工作流程后，您可以使用带--id参数的 get-work flow 来获取更多详细信息。

aws omics get-workflow --type READY2RUN --id workflow id

要运行 Ready2Run 工作流程，您可以使用启动运行 API 操作，并将工作流类型参数设置为，如以下示例所示 READY2RUN

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \
  --workflow-id workflow id \
  --output-uri &example-s3-bucket; \
  --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
  --parameters file:///path/to/parameters.json

要指定工作流程版本，请使用工作流版本参数，如本示例所示。

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \ 
  ...
  --version-name '3.0.0'

要监控您的运行情况，您可以使用 get-run API 操作，如图所示。

aws-omics get-run \
  --id run id