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# Idiomas de fluxo de trabalho suportados para HealthOmics
HealthOmics Os fluxos de trabalho privados suportam definições de fluxo de trabalho escritas em três linguagens de fluxo de trabalho. Cada idioma tem sua própria sintaxe, recursos e suporte de versão. HealthOmics
## Visão geral dos mecanismos de fluxo de trabalho
A tabela a seguir resume os idiomas, as versões e as principais características do fluxo de trabalho suportados. Na tabela, DSL se refere à versão do idioma específico do domínio que cada mecanismo suporta.
| Mecanismo | Versões aceitas | Versões DSL//Spec | Características principais |
| --- | --- | --- | --- |
| Próximo fluxo | v22.04, v23.10, v24.10, v25.10, v26.04 | DSL 1 (somente v22.04), DSL 2 | Groovy-based linguagem de fluxo de dados com paralelismo orientado por canais. Amplamente adotado em genômica por meio da comunidade nf-core. Suporta plug-ins (nf-schema, nf-prov, nf-fgbio, nf-core-utils). |
| WDL | — | Especificação de linguagem 1.0, 1.1, desenvolvimento | Task-oriented linguagem com input/output digitação explícita. Dois modos de motor: WDL (conformidade estrita com as especificações) e WDL leniente (Cromwell-compatible com fundição de tipo implícita). |
| CWL | — | Especificação de idioma 1.0, 1.1, 1.2 | Standards-based, linguagem YAML-defined de fluxo de trabalho mantida pela comunidade Common Workflow Language. Portátil em várias plataformas de execução. |
## Escolhendo um idioma de fluxo de trabalho
Todos os três idiomas têm suporte total HealthOmics e podem acessar os mesmos recursos de computação, armazenamento e rede. As considerações a seguir podem ajudar a informar sua escolha:
+ **Pipelines existentes ** — Se sua organização já mantém pipelines em um idioma, você pode usá-los HealthOmics sem precisar reescrevê-los. HealthOmicsoferece suporte a todas as três linguagens com a mesma infraestrutura subjacente de computação, armazenamento e rede.
+ **Características da linguagem ** — O Nextflow usa um modelo de fluxo de Groovy-based dados com paralelismo orientado por canais e oferece suporte a plug-ins. A WDL usa input/output digitação explícita com uma estrutura orientada a tarefas. O CWL usa uma YAML-based abordagem declarativa projetada para portabilidade entre plataformas.
+ **Open-source ecossistema ** — Cada idioma tem uma comunidade ativa de código aberto com canais e ferramentas disponíveis publicamente. Para obter mais informações, consulte as especificações de [ WDL](https://github.com/openwdl/wdl), [ Nextflow ](https://www.nextflow.io/) ou CWL. [https://www.commonwl.org/](https://www.commonwl.org/)
## Detalhes da versão por idioma
Para obter suporte detalhado à versão, recursos específicos do idioma e diretrizes de configuração, consulte as seguintes páginas:
+ [Suporte de versão para linguagens HealthOmics de definição de fluxo de trabalho](workflows-lang-versions.md)— Matriz de versões completa para todos os três idiomas, incluindo como HealthOmics detecta e seleciona versões.
+ [Especificações da definição do fluxo de trabalho do Nextflow](workflow-definition-nextflow.md)— Sintaxe DSL do Nextflow, diretivas, plug-ins, perfis, relatórios de execução e configurações do mecanismo.
+ [Notas de lançamento da versão Nextflow para HealthOmics](nextflow-version-release-notes.md)— Notas de lançamento para cada versão compatível do Nextflow em. HealthOmics
+ [Especificações da definição do fluxo de trabalho WDL](workflow-languages-wdl.md)— Suporte à versão WDL, coerção de tipo, modo leniente WDL e tratamento de estruturas.
+ [Registro de alterações do mecanismo WDL para HealthOmics](wdl-engine-change-log.md)— Registro de alterações de novos recursos, aprimoramentos e descontinuações do mecanismo WDL ativado. HealthOmics
+ [Especificidades da definição do fluxo de trabalho do CWL](workflow-languages-cwl.md)— Suporte à versão CWL, formatos de entrada e requisitos do Docker.
## Ciclo de vida da versão do mecanismo Nextflow
HealthOmics mantém uma cadência regular para oferecer suporte às novas versões do mecanismo Nextflow. O Nextflow normalmente lança uma versão estável a cada seis meses e HealthOmics adiciona suporte contínuo para essas versões. Para ver a política completa do ciclo de vida da versão Nextflow, incluindo cronogramas de descontinuação e preços de disponibilidade estendida da versão, consulte a seguinte página:
+ [Política de retenção de versões do Nextflow](nextflow-version-retention-policy.md)— Versões compatíveis, por quanto tempo elas permanecem disponíveis, fases de descontinuação, preços de disponibilidade estendida de versões, gerenciamento de plug-ins e diretrizes de teste.
## Tópicos relacionados
+ [Arquivos de definição de fluxo de trabalho em HealthOmics](workflow-definition-files.md)— Como estruturar seu ZIP de definição de fluxo de trabalho, requisitos e exemplos.
+ [Criação de fluxos de trabalho privados no HealthOmics](workflows-setup.md)— End-to-end guia para criar um fluxo de trabalho em HealthOmics.
+ [Comece uma corrida em HealthOmics](starting-a-run.md)— Como iniciar a execução de um fluxo de trabalho, incluindo as configurações do mecanismo.
**Topics**
+ [Visão geral dos mecanismos de fluxo de trabalho](#workflows-supported-languages-overview)
+ [Escolhendo um idioma de fluxo de trabalho](#workflows-choosing-language)
+ [Detalhes da versão por idioma](#workflows-version-details-by-language)
+ [Ciclo de vida da versão do mecanismo Nextflow](#workflows-nextflow-version-lifecycle)
+ [Tópicos relacionados](#workflows-supported-languages-related)
+ [Política de retenção de versões do Nextflow](nextflow-version-retention-policy.md)
+ [Notas de lançamento da versão Nextflow para HealthOmics](nextflow-version-release-notes.md)
+ [Registro de alterações do mecanismo WDL para HealthOmics](wdl-engine-change-log.md)