Uso de bibliotecas Python com o EMR Sem Servidor - Amazon EMR

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Uso de bibliotecas Python com o EMR Sem Servidor

Ao executar PySpark trabalhos em aplicativos sem servidor do Amazon EMR, empacote várias bibliotecas Python como dependências. Para fazer isso, use recursos nativos do Python, crie um ambiente virtual ou configure diretamente seus PySpark trabalhos para usar bibliotecas do Python. Esta página fala sobre cada abordagem.

Uso dos recursos nativos do Python

Ao definir a configuração a seguir, use PySpark para fazer upload de arquivos Python (.py), pacotes Python compactados () e arquivos Egg .zip () para os executores do Spark.egg.

--conf spark.submit.pyFiles=s3://amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/<.py|.egg|.zip file>

Para obter mais detalhes sobre como usar ambientes virtuais Python para PySpark trabalhos, consulte Usando recursos PySpark nativos.

Ao usar o EMR Notebook, você pode disponibilizar a dependência do Python em seu Notebook executando o seguinte código:

%%configure -f { "conf": { "spark.submit.pyFiles":"s3:///amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/<.py|.egg|.zip file> } }

Criação de um ambiente virtual Python

Para empacotar várias bibliotecas Python para um PySpark trabalho, crie ambientes virtuais Python isolados.

  1. Para criar o ambiente virtual em Python, use os comandos a seguir. O exemplo mostrado instala os pacotes scipy e matplotlib em um pacote de ambiente virtual e copia o arquivo para um local do Amazon S3.

    Importante

    Você deve executar os comandos a seguir em um ambiente do Amazon Linux 2 similar com a mesma versão do Python usada no EMR Sem Servidor, ou seja, Python 3.7.10 para o Amazon EMR versão 6.6.0. Você pode encontrar um exemplo de Dockerfile no repositório EMR Serverless Samples. GitHub

    # initialize a python virtual environment python3 -m venv pyspark_venvsource source pyspark_venvsource/bin/activate # optionally, ensure pip is up-to-date pip3 install --upgrade pip # install the python packages pip3 install scipy pip3 install matplotlib # package the virtual environment into an archive pip3 install venv-pack venv-pack -f -o pyspark_venv.tar.gz # copy the archive to an S3 location aws s3 cp pyspark_venv.tar.gz s3://amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/ # optionally, remove the virtual environment directory rm -fr pyspark_venvsource
  2. Envie o trabalho do Spark com suas propriedades definidas para usar o ambiente virtual do Python.

    --conf spark.archives=s3://amzn-s3-demo-bucket/EXAMPLE-PREFIX/pyspark_venv.tar.gz#environment --conf spark.emr-serverless.driverEnv.PYSPARK_DRIVER_PYTHON=./environment/bin/python --conf spark.emr-serverless.driverEnv.PYSPARK_PYTHON=./environment/bin/python --conf spark.executorEnv.PYSPARK_PYTHON=./environment/bin/python

    Observe que, se você não substituir o binário original do Python, a segunda configuração na sequência de configurações anterior será --conf spark.executorEnv.PYSPARK_PYTHON=python.

    Para saber mais sobre como usar ambientes virtuais Python para PySpark trabalhos, consulte Usando o Virtualenv. Para ver mais exemplos de como enviar trabalhos para o Spark, consulte. Uso das configurações do Spark ao executar trabalhos do EMR Sem Servidor

Configurando PySpark trabalhos para usar bibliotecas Python

Com as versões 6.12.0 e posteriores do Amazon EMR, você pode configurar diretamente trabalhos do EMR Serverless PySpark para usar bibliotecas Python populares de ciência de dados, como pandas, e sem nenhuma configuração adicional. NumPyPyArrow

Os exemplos a seguir demonstram como empacotar cada biblioteca Python para um PySpark trabalho.

NumPy

NumPy é uma biblioteca Python para computação científica que oferece matrizes e operações multidimensionais para matemática, classificação, simulação aleatória e estatísticas básicas. Para usar NumPy, execute o seguinte comando:

import numpy
pandas

pandas é uma biblioteca Python baseada em. NumPy A biblioteca pandas fornece aos cientistas de dados estruturas de DataFramedados e ferramentas de análise de dados. Para usar o pandas, execute o seguinte comando:

import pandas
PyArrow

PyArrow é uma biblioteca Python que gerencia dados colunares na memória para melhorar o desempenho no trabalho. PyArrow é baseado na especificação de desenvolvimento multilíngue Apache Arrow, que é uma forma padrão de representar e trocar dados em um formato colunar. Para usar PyArrow, execute o seguinte comando:

import pyarrow