As traduções são geradas por tradução automática. Em caso de conflito entre o conteúdo da tradução e da versão original em inglês, a versão em inglês prevalecerá. # Ligue para variantes genéticas com bwa e bcftools no Deadline Cloud O pacote de [ tarefas ](https://github.com/aws-deadline/deadline-cloud-samples/tree/mainline/job_bundles/variant_calling_bwa) variant\_calling\_bwa no GitHub site encontra as diferenças genéticas entre um indivíduo e um genoma de referência. Ele alinha as leituras de sequenciamento com`bwa`, chama as variantes e mescla os resultados em um arquivo VCF. `bcftools` O pipeline reimplementa o pipeline de tutoriais de chamada de variantes do AWS HealthOmics WDL no Open Job Description. O pacote demonstra padrões que são transferidos para outras cargas de trabalho científicas: + Software fornecido como pacotes conda a partir do canal bioconda, em vez de incorporado às imagens do contêiner. + Fan-out sobre dois parâmetros de tarefa diferentes: dispersões de alinhamento sobre amostras e dispersões de chamadas de variantes sobre regiões do genoma, com uma etapa de mesclagem à medida que a coleta. + Um ambiente de trabalho que verifica se todas as ferramentas necessárias estão ativadas `PATH` uma vez por sessão e relata os pacotes e canais exatos para configurar se alguma estiver faltando. O pacote exige uma fazenda com uma frota Linux, um ambiente de fila conda com canais definidos `conda-forge bioconda` nessa ordem e a CLI do Deadline Cloud. Faça o download dos dados da amostra (cerca de 950 KB) e envie: ``` python sample_inputs/fetch_test_data.py deadline bundle submit . ``` Os parâmetros padrão (2 amostras, 4 regiões) produzem 10 tarefas. O README abrange trazer sua própria coorte, escalar a lista de regiões e as etapas que uma análise de produção adicionaria. Para outros exemplos de biociências, consulte [Preveja estruturas de proteínas com eSMFold no Deadline Cloud](examples-jb-esmfold.md)[Execute simulações de dinâmica molecular GROMACS no Deadline Cloud](examples-jb-gromacs.md), e. [Faça uma exibição virtual com a AutoDock Vina no Deadline Cloud](examples-jb-virtual-screening.md)