HealthOmics 주석 저장소 생성 - AWS HealthOmics
콘솔을 사용하여 주석 저장소 생성API를 사용하여 주석 저장소 생성

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HealthOmics 주석 저장소 생성

중요

AWS HealthOmics 변형 저장소 및 주석 저장소는 더 이상 신규 고객에게 공개되지 않습니다. 기존 고객은 정상적으로 서비스를 계속 이용할 수 있습니다. 자세한 내용은 AWS HealthOmics 변형 저장소 및 주석 저장소 가용성 변경 단원을 참조하십시오.

주석 저장소는 TSV, VCF 또는 GFF 파일의 것과 같은 주석 데이터베이스를 나타내는 데이터 저장소입니다. 동일한 참조 유전체가 지정되면 주석 저장소는 가져오기 중에 변형 저장소와 동일한 좌표계에 매핑됩니다. 다음 주제에서는 HealthOmics 콘솔 및를 사용하여 주석 저장소 AWS CLI 를 생성하고 관리하는 방법을 보여줍니다.

콘솔을 사용하여 주석 저장소 생성

다음 절차에 따라 HealthOmics 콘솔을 사용하여 주석 저장소를 생성합니다.

주석 저장소를 생성하려면

  1. HealthOmics 콘솔을 엽니다.

  2. 필요한 경우 왼쪽 탐색 창(™)을 엽니다. 주석 저장소를 선택합니다.

  3. 주석 저장소 페이지에서 주석 저장소 생성을 선택합니다.

  4. 주석 저장소 생성 페이지에서 다음 정보를 제공합니다.

    • 주석 저장소 이름 -이 저장소의 고유한 이름입니다.

    • 설명(선택 사항) -이 참조 유전체에 대한 설명입니다.

    • 데이터 형식 및 스키마 세부 정보 - 데이터 파일 형식을 선택하고이 저장소에 대한 스키마 정의를 업로드합니다.

    • 참조 유전체 -이 주석의 참조 유전체입니다.

    • 데이터 암호화 - 데이터 암호화를 직접 소유 및 관리할지 여부를 선택합니다 AWS .

    • 태그(선택 사항) -이 주석 저장소에 최대 50개의 태그를 제공합니다.

  5. 주석 저장소 생성을 선택합니다.

API를 사용하여 주석 저장소 생성

다음 예제에서는를 사용하여 주석 저장소를 생성하는 방법을 보여줍니다 AWS CLI. 모든 AWS CLI 및 API 작업에 대해 데이터 형식을 지정해야 합니다.

aws omics create-annotation-store --name my_annotation_store \
           --store-format GFF \
           --reference referenceArn="arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/6505293348/reference/5987565360"
           --version-name new_version

주석 저장소 생성을 확인하는 다음 응답을 받게 됩니다.

{
           "creationTime": "2022-08-24T20:34:19.229500Z",
           "id": "3b93cdef69d2",
           "name": "my_annotation_store",
           "reference": {
               "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/6505293348/reference/5987565360"
           },
           "status": "CREATING"
           "versionName": "my_version"
       }

주석 저장소에 대해 자세히 알아보려면 get-annotation-store API를 사용합니다.

aws omics get-annotation-store --name my_annotation_store

다음과 같은 응답을 받게 됩니다.

{
          "id": "eeb019ac79c2",
          "reference": {
              "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/5638433913/reference/5871590330“
          },
          "status": "ACTIVE",
          "storeArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:annotationStore/gffstore",
          "name": "my_annotation_store",
          "creationTime": "2022-11-05T00:05:19.136131+00:00",
          "updateTime": "2022-11-05T00:10:36.944839+00:00",
          "tags": {},
          "storeFormat": "GFF",
          "statusMessage": "",
          "storeSizeBytes": 0,
          "numVersions": 1
      }

계정과 연결된 모든 주석 저장소를 보려면 list-annotation-stores API 작업을 사용합니다.

aws omics list-annotation-stores

다음 예제 응답과 같이 ID, IDs 상태 및 기타 세부 정보와 함께 모든 주석 저장소를 나열하는 응답을 받습니다.

{
           "annotationStores": [
               {
                  "id": "4d8f3eada259",
                   "reference":
                       "referenceArn": "arn:aws:omics:us-west-2:555555555555:referenceStore/5638433913/reference/5871590330"
                   },
                   "status": "CREATING",
                   "name": "gffstore",
                   "creationTime": "2022-09-27T17:30:52.182990+00:00",
                   "updateTime": "2022-09-27T17:30:53.025362+00:00"
               }
           ]
       }

상태 또는 기타 기준에 따라 응답을 필터링할 수도 있습니다.