API를 사용하여 HealthOmics Ready2Run 워크플로 시작 - AWS HealthOmics

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API를 사용하여 HealthOmics Ready2Run 워크플로 시작

대부분의 API 작업은 Ready2Run 워크플로와 프라이빗 워크플로에서 유사한 방식으로 작동합니다.

사용 가능한 Ready2Run 워크플로 목록을 반환하려면 type 파라미터가 READY2RUN으로 설정된 list-workflows를 사용합니다.

aws omics list-workflows --type READY2RUN

list-workflows 응답에서 실행할 워크플로를 식별한 후 --id 파라미터와 함께 get-workflow를 사용하여 자세한 내용을 가져올 수 있습니다.

aws omics get-workflow --type READY2RUN --id workflow id

Ready2Run 워크플로를 실행하려면 다음 예제와 READY2RUN같이 워크플로 유형 파라미터가 로 설정된 상태에서 시작-실행 API 작업을 사용할 수 있습니다.

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \
  --workflow-id workflow id \
  --output-uri &example-s3-bucket; \
  --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
  --parameters file:///path/to/parameters.json

워크플로 버전을 지정하려면이 예제와 같이 워크플로 버전 파라미터를 사용합니다.

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \ 
  ...
  --version-name '3.0.0'

다음과 같이 실행을 모니터링하기 위해 get-run API 작업을 사용할 수 있습니다.

aws-omics get-run \
  --id run id