API を使用して HealthOmics Ready2Run ワークフローを開始する - AWS HealthOmics

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API を使用して HealthOmics Ready2Run ワークフローを開始する

ほとんどの API オペレーションは、Ready2Run ワークフローとプライベートワークフローと同様に動作します。

使用可能な Ready2Run ワークフローのリストを返すには、 typeパラメータを READY2RUN に設定して list-workflows を使用します。

aws omics list-workflows --type READY2RUN

list-workflows レスポンスから実行するワークフローを特定したら、 --idパラメータで get-workflow を使用して詳細を取得できます。

aws omics get-workflow --type READY2RUN --id workflow id

Ready2Run ワークフローを実行するには、次の例に示すようにREADY2RUN、ワークフロータイプパラメータを に設定して Start-run API オペレーションを使用できます。

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \
  --workflow-id workflow id \
  --output-uri &example-s3-bucket; \
  --role-arn arn:aws:iam::1234567892012:role/service-role/OmicsWorkflow-20221004T164236 \
  --parameters file:///path/to/parameters.json

ワークフローバージョンを指定するには、この例に示すように Workflow-version パラメータを使用します。

aws-omics start-run \
  --workflow-type READY2RUN \ 
  ...
  --version-name '3.0.0'

実行をモニタリングするには、次に示すように get-run API オペレーションを使用できます。

aws-omics get-run \
  --id run id