翻訳は機械翻訳により提供されています。提供された翻訳内容と英語版の間で齟齬、不一致または矛盾がある場合、英語版が優先します。 # HealthLake 統合 NLP リクエストの例 **例 1: HealthLake データストアに取り込まれた`Patient`レコード** 以下は、医療専門家との`Patient`遭遇に基づく臨床記録の例です。 **合成データ** 次の例のテキストは合成コンテンツであり、保護された医療情報 (PHI) は含まれていません。 ``` 1991-08-31 # Chief Complaint - Headache - Sinus Pain - Nasal Congestion - Sore Throat - Pain with Bright Lights - Nasal Discharge - Cough # History of Present Illness Jerónimo599 is a 4 month-old non-hispanic white male. # Social History Patient has never smoked. Patient comes from a middle socioeconomic background. Patient currently has Aetna. # Allergies No Known Allergies. # Medications No Active Medications. # Assessment and Plan Patient is presenting with bee venom (substance), mold (organism), house dust mite (organism), animal dander (substance), grass pollen (substance), tree pollen (substance), lisinopril, sulfamethoxazole / trimethoprim, fish (substance). ## Plan The patient was prescribed the following medications: - astemizole 10 mg oral tablet - nda020800 0.3 ml epinephrine 1 mg/ml auto-injector The patient was placed on a careplan: - self-care interventions (procedure) ``` 注意点として、この情報は `DocumentReference`リソースの base64 形式でエンコードされます。このドキュメントが HealthLake に取り込まれ、Amazon Comprehend Medical API オペレーションが完了すると、結果を表示するには、`DocumentReference`リソースタイプの`GET`リクエストから開始できます。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/DocumentReference ``` Amazon Comprehend Medical API オペレーションが成功したら、以下`extension`にリンクされた 内でこれらのキーと値のペアを探します。 `"url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/"` ``` { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/status/", "valueString": "SUCCESS" }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/message/", "valueString": "The AWS HealthLake integrated medical NLP operation was successful." } ``` 次のタブは、リソースタイプに基づいて、取り込まれた医療記録が HealthLake データストアにどのように報告されるかを示しています。 ------ #### [ DocumentReference ] 単一の`DocumentReference`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`id`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/DocumentReference/0e938f03-da7f-4178-acd8-eea9586c46ed ``` 成功すると、`200`HTTP レスポンスコードと次の JSON レスポンス (わかりやすくするために切り捨てられています) を取得します。 以下にその`http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-resources/`部分を示します。新しい `Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a` が追加されたことを確認できます。また、HealthLake が特定の `Observation`および`Condition`リソースタイプに推論ベースの検出結果を追加した場所を確認することもできます。 これらのリソースタイプがどのように修正されたかを確認するには、関連するタブを選択します。 ``` { "extension": [ { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "Observation/c6e0a3ff-7a17-4d8b-bfd0-d02d7da090c5" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "Condition/0854e1f3-894d-448e-a8d9-3af5b9902baf" } } ], "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-resources/" } ``` ------ #### [ Linkage ] 単一の`Linkage`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`ID`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a ``` 成功すると、HTTP `200` レスポンスコードと、次の切り捨てられた JSON レスポンスを取得します。 レスポンスには `item`要素が含まれています。キーと値のペアは、 の変更に使用され、`"type": "alternate"`キー`Condition`と値のペアの下に`Observations`リストされている特定の`DocumentReference`エントリ`"type": "source"`を示します。 *また、 `meta`要素、およびこれらのリソースが HealthLake によって作成された`"tag": [{"display": "SYSTEM_GENERATED"}]`ことを示す対応するキーと値のペア も表示されます。* ``` { "resourceType": "Linkage", "id": "e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a", "active": true, "item": [ { "type": "alternate", "resource": { "reference": "Observation/c6e0a3ff-7a17-4d8b-bfd0-d02d7da090c5", "type": "Observation" } }, { "type": "alternate", "resource": { "reference": "Condition/9d5c1ef6-f822-4faf-b55f-7c70f2a4aa8d", "type": "Condition" } }, { "type": "source", "resource": { "reference": "DocumentReference/0e938f03-da7f-4178-acd8-eea9586c46ed", "type": "DocumentReference" } } ], "meta": { "lastUpdated": "2022-10-21T19:38:31.327Z", "tag": [{ "display": "SYSTEM_GENERATED" }] } } ``` ------ #### [ Resource type: Observation ] 単一の`Observation`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`ID`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/Observation/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a ``` Amazon Comprehend Medical API オペレーションの結果は`code`、、`meta`、および の要素に変更されます`modifierExtension`。 **`code`** タイプの 要素`CodeableConcept`。詳細については、**FHIR R4 ドキュメント**[https://hl7.org/fhir/R4/datatypes.html#CodeableConcept](https://hl7.org/fhir/R4/datatypes.html#CodeableConcept)の「」を参照してください。 HealthLake は、次の 3 つのキーと値のペアを追加します。 + `"system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/"`: URL は特定の Amazon Comprehend Medical API オペレーションを参照します。この場合、InferICD10CM。 + `"code": "A52.06"`: `A52.06`は、Centers for Disease Control のナレッジベースにある概念を識別する ICD-10-CM コードです。 + `"display": "Other syphilitic heart involvement"`: `"Other syphilitic heart involvement"`はオントロジー内の ICD-10-CM コードの長い説明です。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `code`要素のみが含まれます。 ``` "code": { "coding": [ { "system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/", "code": "A52.06", "display": "Other syphilitic heart involvement" } ], "text": "Other syphilitic heart involvement" } ``` 割り当てられた ICD-10-CM コードが正しいというモデルの信頼度を理解するには、 `modifierExtension`要素を使用します。 **`meta`** `meta` 要素には、Amazon Comprehend Medical API オペレーションによって追加された詳細が`code`要素に含まれているかどうかを示すメタデータが含まれています。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `meta`要素のみが含まれます。 ``` "meta": { "lastUpdated": "2022-10-21T19:38:30.879Z", "tag": [{ "display": "SYSTEM_GENERATED" }] } ``` **`modifierExtension`** `modifierExtension` 要素には、 `code`要素で見つかった割り当てられたコードの信頼度に関する詳細が含まれます。また、結果の生成に使用される元の DocumentReference へのリンクと関連する Linkage リソースタイプを提供するキーと値のペアもあります。 追加される`coding`要素ごとに、modifierExtension に `entity-score`と `entity-Concept-Score`が追加されます。キーと値のペアの値ごとに、スコアが表示されます。の場合`entity-score`、このスコアは Amazon Comprehend Medical が検出の精度に対して持っている信頼度です。の場合`entity-Concept-Score`、このスコアは、エンティティが ICD-10-CM 概念に正確にリンクされているという Amazon Comprehend Medical の信頼度です。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `modifierExtension`要素のみが含まれます。 ``` "modifierExtension": [{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-score", "valueDecimal": 0.45005733 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-Concept-Score", "valueDecimal": 0.1111792 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/source-document-reference", "valueReference": { "reference": "DocumentReference/0e938f03-da7f-4178-acd8-eea9586c46ed" } } ] ``` **完全な JSON レスポンス** ``` { "subject": { "reference": "Patient/0679b7b7-937d-488a-b48d-6315b8e7003b" }, "resourceType": "Observation", "status": "unknown", "code": { "coding": [{ "system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/", "code": "A52.06", "display": "Other syphilitic heart involvement" }], "text": "Other syphilitic heart involvement" }, "meta": { "lastUpdated": "2022-10-21T19:38:30.879Z", "tag": [{ "display": "SYSTEM_GENERATED" }] }, "modifierExtension": [{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-score", "valueDecimal": 0.45005733 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-Concept-Score", "valueDecimal": 0.1111792 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/source-document-reference", "valueReference": { "reference": "DocumentReference/0e938f03-da7f-4178-acd8-eea9586c46ed" } } ], "id": "7e88c7c5-21a5-4dd7-8fc2-a02474fba583" } ``` ------ #### [ Condition ] 単一の`Condition`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`ID`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/Condition/b06d343d-ddb8-4f36-82cb-853fcd434dfd ``` Amazon Comprehend Medical API オペレーションの結果は`code`、、`meta`、および の要素に変更されます`modifierExtension`。 **`code`** タイプの 要素`CodeableConcept`。詳細については、**FHIR R4 ドキュメント**[https://hl7.org/fhir/R4/datatypes.html#CodeableConcept](https://hl7.org/fhir/R4/datatypes.html#CodeableConcept)の「」を参照してください。 HealthLake は、次の 3 つのキーと値のペアを追加します。 + `"system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/"`: URL は特定の Amazon Comprehend Medical API オペレーションを参照します。この場合、InferICD10CM。 + `"code": "I70.0"`: `A52.06`は、Centers for Disease Control のナレッジベースにある概念を識別する ICD-10-CM コードです。 + `"display": "Atherosclerosis of aorta"`: `"Other syphilitic heart involvement"`はオントロジー内の ICD-10-CM コードの長い説明です。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `code`要素のみが含まれます。 ``` "code": { "coding": [ { "system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/", "code": "I70.0", "display": "Atherosclerosis of aorta" } ], "text": "Atherosclerosis of aorta" } ``` 割り当てられた ICD-10-CM コードが正しいというモデルの信頼度を理解するには、 `modifierExtension`要素を使用します。 **`meta`** `meta` 要素には、Amazon Comprehend Medical API オペレーションによって追加された詳細が`code`要素に含まれているかどうかを示すメタデータが含まれています。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `meta`要素のみが含まれます。 ``` "meta": { "lastUpdated": "2022-10-21T19:38:30.877Z", "tag": [{ "display": "SYSTEM_GENERATED" }] } ``` **`modifierExtension`** `modifierExtension` 要素には、 `code`要素で見つかった割り当てられたコードの信頼度に関する詳細が含まれます。また、結果の生成に使用される元の DocumentReference へのリンクと関連する Linkage リソースタイプを提供するキーと値のペアもあります。 追加される`coding`要素ごとに、modifierExtension に `entity-score`と `entity-Concept-Score`が追加されます。キーと値のペアの値ごとに、スコアが表示されます。の場合`entity-score`、このスコアは Amazon Comprehend Medical が検出の精度に対して持っている信頼度です。の場合`entity-Concept-Score`、このスコアは、エンティティが ICD-10-CM 概念に正確にリンクされているという Amazon Comprehend Medical の信頼度です。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `modifierExtension`要素のみが含まれます。 ``` "modifierExtension": [{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-score", "valueDecimal": 0.94417894 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-Concept-Score", "valueDecimal": 0.8458298 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/source-document-reference", "valueReference": { "reference": "DocumentReference/0e938f03-da7f-4178-acd8-eea9586c46ed" } } ] ``` **完全な JSON レスポンス** ``` { "subject": { "reference": "Patient/0679b7b7-937d-488a-b48d-6315b8e7003b" }, "resourceType": "Condition", "code": { "coding": [{ "system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/", "code": "I70.0", "display": "Atherosclerosis of aorta" }], "text": "Atherosclerosis of aorta" }, "meta": { "lastUpdated": "2022-10-21T19:38:30.877Z", "tag": [{ "display": "SYSTEM_GENERATED" }] }, "modifierExtension": [{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-score", "valueDecimal": 0.94417894 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-icd10/aws-cm-icd10-entity-Concept-Score", "valueDecimal": 0.8458298 }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/e366d29f-2c22-4c19-866e-09603937935a" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/source-document-reference", "valueReference": { "reference": "DocumentReference/0e938f03-da7f-4178-acd8-eea9586c46ed" } } ], "id": "b06d343d-ddb8-4f36-82cb-853fcd434dfd" } ``` ------ **例 2: `MedicationStatement`リソースタイプ`DocumentReference`を含む ** 以下は、患者の医療専門家との出会いに基づく臨床メモの例です。 **合成データ** この例のテキストは合成コンテンツであり、保護された医療情報 (PHI) は含まれていません。 ``` Tom is not prescribed Advil ``` 次のタブは、リソースタイプに基づいて、取り込まれた医療記録が HealthLake データストアにどのように報告されるかを示しています。 ------ #### [ DocumentReference ] 単一の`DocumentReference`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`ID`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/DocumentReference/c549125d-a218-421f-b8bf-23614c5e796c ``` 成功すると、HTTP `200` レスポンスコードと、次の切り捨てられた JSON レスポンスを取得します。 キーと値のペア は`"url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-resources/"`、この中のリソースタイプ`extension`が Amazon Comprehend Medical API オペレーションによって追加されたことを示します。新しい`Linkage`リソースタイプと複数の`MedicationStatement`リソースを表示できます。 ``` "extension": [{ "extension": [{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/394bb244-177b-4409-8657-26b20ed56dd7" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "MedicationStatement/cbf6af10-b0b9-451c-bdde-99611e3498a8" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "MedicationStatement/9a89b0d3-6681-45ca-9926-27951edce5c7" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "MedicationStatement/4a01f6c8-5f3a-4122-80ab-405312f96aa2" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "MedicationStatement/fbfb77d8-70cf-4579-b4c0-d6fe3c01656b" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/nlp-entity", "valueReference": { "reference": "MedicationStatement/1340c9ce-9c48-4bf9-9b2f-d0ab027f5e0b" } } ], "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-resources/" } ``` ------ #### [ Linkage ] 単一の`Linkage`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`ID`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/Linkage/394bb244-177b-4409-8657-26b20ed56dd7 ``` 成功すると、HTTP `200` レスポンスコードと次の JSON レスポンスを取得します。 レスポンスには `item`要素が含まれています。キーと値のペアは、`MedicationStatement`リソースタイプの変更に使用される特定の`DocumentReference`エントリ`"type": "source"`を示します。 また、 `meta`要素と対応するキーと値のペア を表示して`"tag": [{"display": "SYSTEM_GENERATED"}]`、これらのリソースが HealthLake によって作成されたことを示すこともできます。 ``` { "resourceType": "Linkage", "id": "394bb244-177b-4409-8657-26b20ed56dd7", "active": true, "item": [{ "type": "alternate", "resource": { "reference": "MedicationStatement/cbf6af10-b0b9-451c-bdde-99611e3498a8", "type": "MedicationStatement" } }, { "type": "alternate", "resource": { "reference": "MedicationStatement/9a89b0d3-6681-45ca-9926-27951edce5c7", "type": "MedicationStatement" } }, { "type": "alternate", "resource": { "reference": "MedicationStatement/4a01f6c8-5f3a-4122-80ab-405312f96aa2", "type": "MedicationStatement" } }, { "type": "alternate", "resource": { "reference": "MedicationStatement/fbfb77d8-70cf-4579-b4c0-d6fe3c01656b", "type": "MedicationStatement" } }, { "type": "alternate", "resource": { "reference": "MedicationStatement/1340c9ce-9c48-4bf9-9b2f-d0ab027f5e0b", "type": "MedicationStatement" } }, { "type": "source", "resource": { "reference": "DocumentReference/c549125d-a218-421f-b8bf-23614c5e796c", "type": "DocumentReference" } } ], "meta": { "lastUpdated": "2022-10-24T20:05:03.501Z", "tag": [{ "display": "SYSTEM_GENERATED" }] } } ``` ------ #### [ MedicationStatement ] 単一の`MedicationStatement`リソースタイプの結果を表示するには、特定のリソース`ID`の が提供されている`GET`リクエストを行います。 ``` GET https://https://healthlake.region.amazonaws.com/datastore/datastoreId/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd/r4/MedicationStatement/9a89b0d3-6681-45ca-9926-27951edce5c7 ``` `MedicationStatement` リソースタイプは、Amazon Comprehend Medical InferRxNorm API オペレーションの結果が見つかった場所です。結果は、、`medicationCodeableConcept`、`meta`および の要素に修正されます`modifierExtension`。 **medicationCodeableConcept** タイプの 要素`CodeableConcept`。詳細については、**FHIR R4 ドキュメント**[https://hl7.org/fhir/R4/datatypes.html#CodeableConcept](https://hl7.org/fhir/R4/datatypes.html#CodeableConcept)の「」を参照してください。 HealthLake は、次の 3 つのキーと値のペアを追加します。 + `"system": ""http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-rxnorm/`: URL は特定の Amazon Comprehend Medical API オペレーションを参照します。この場合、InferRxNorm。 + `"code": "731533"`: `731533`は、RxCUI とも呼ばれる RxNorm 概念 ID です。 RxCUI + `"display": "ibuprofen 200 MG Oral Capsule [Advil]"`: ここで、 `ibuprofen 200 MG Oral Capsule [Advil]`は RxNorm 概念の説明です。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `MedicationStatement`要素のみが含まれます。 ``` "medicationCodeableConcept": { "coding": [ { "system": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/infer-rxnorm/", "code": "731533", "display": "ibuprofen 200 MG Oral Capsule [Advil]" } ] } ``` **`meta`** `meta` 要素には、Amazon Comprehend Medical API オペレーションによって追加された詳細が`code`要素に含まれているかどうかを示すメタデータが含まれています。 次の切り捨てられた JSON レスポンスには、 `meta`要素のみが含まれます。 ``` "meta": { "lastUpdated": "2022-10-24T20:05:02.800Z", "tag": [ { "display": "SYSTEM_GENERATED" } ] } ``` **`modifierExtension`** `modifierExtension` 要素には、結果の生成`DocumentReference`に使用される元の および関連する Linkage リソースタイプへのリンクを提供するキーと値のペアが含まれています。 ``` "modifierExtension": [ { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-linkage", "valueReference": { "reference": "Linkage/394bb244-177b-4409-8657-26b20ed56dd7" } }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/source-document-reference", "valueReference": { "reference": "DocumentReference/c549125d-a218-421f-b8bf-23614c5e796c" } } ] ``` ------