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Cómo se integra Amazon Comprehend Medical con HealthLake
HealthLake deduce los datos encontrados en el tipo de DocumentReference
recurso mediante Amazon Comprehend Medical. Los Amazon Comprehend API Medical DetectEntities-V2
Operations InferICD10-CM
InferRxNorm
y detectan las afecciones médicas como rasgos. Cada operación proporciona información diferente.
Lenguajes compatibles
Las operaciones de Amazon Comprehend API Medical solo detectan entidades médicas en textos en inglés.
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DetectEntities-V2: inspecciona el texto clínico para detectar diversas entidades médicas y devuelve información específica sobre ellas, como la categoría de la entidad, la ubicación y el puntaje de confianza.
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Inferir el ICD1 0-CM: detecta las afecciones médicas en el registro de un paciente como entidades y vincula esas entidades con los identificadores de conceptos normalizados de la base de conocimientos del ICD -10-CM del Centro CDC Nacional de Estadísticas de Salud, con la autorización de la Organización Mundial de la Salud (). WHO
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InferRxNorm: Detecta los medicamentos como entidades incluidas en la historia clínica de un paciente y los vincula a los identificadores conceptuales normalizados de la base de datos de la RxNorm Biblioteca Nacional de Medicina.
Los rasgos compatibles para cada API operación son SIGN
SYMPTOM
, y. DIAGNOSIS
Si se detectan rasgos, se agregan como extensiones FHIR compatibles a diferentes ubicaciones del almacén de HealthLake datos.
Ubicaciones donde se agregan las extensiones.
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DocumentReference
: Los resultados de las operaciones de Amazon Comprehend API Medical se añaden comoextension
a cada documento que se encuentra dentro DocumentReference del tipo de recurso. Los resultados de la extensión se dividen en dos grupos. Puede encontrarlos en los resultados en función de susURL
.-
http://healthlake.amazonaws.com/system-generated-resources/
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Estos son tipos de recursos que han sido creados o añadidos por HealthLake.
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http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/
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Donde el resultado bruto de las operaciones de Amazon Comprehend API Medical se añade a HealthLake su almacén de datos.
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Linkage
: Este tipo de recurso se agrega o se crea como resultado de la integraciónNLP. UnaGET
solicitud sobre un objeto específicoLinkage
devuelve una lista de recursos enlazados. Para identificar si aLinkage
fue agregado por HealthLake, busca el par"tag": [{"display": "SYSTEM_GENERATED"}]
clave-valor agregado. Para obtener más información sobre las FHIR especificaciones de la vinculación, consulte Tipo de recurso: Vinculaciónen el índice de documentación. FHIR -
FHIRtipos de recursos generados como resultado de las operaciones de Amazon Comprehend API Medical.
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Observation
: Se le añaden los resultados de las DetectEntities operaciones de Amazon Comprehend API Medical -V2 e ICD1 Infer 0-CM cuando los rasgos son o.SIGN
SYMPTOM
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Condition
: Se le añaden los resultados de las DetectEntities operaciones de Amazon Comprehend API Medical -V2 e ICD1 Infer 0-CM cuando los rasgos son.DIAGNOSIS
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MedicationStatement
: Se le han añadido los resultados de la InferRxNorm operación Amazon Comprehend API Medical.
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Integración con las operaciones FHIR REST API
De forma predeterminada, las características detectadas por las operaciones de Amazon Comprehend API Medical no se devuelven al realizar GET
una solicitud.
Para ver los resultados de las NLP operaciones integradas para estos tipos de recursos, debe especificar uno conocidoID
.
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Linkage
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Observation
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Condition
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MedicationStatement
Los resultados de las NLP operaciones integradas fuera del tipo de DocumentReference recurso solo están disponibles mediante una GET
solicitud en la que ID
se sepa que lo especificado contiene resultados de las operaciones de Amazon Comprehend API Medical.
Ejemplos de cómo se integran las operaciones de Amazon Comprehend API Medical en HealthLake
Ejemplo 1: registro de un paciente ingresado en un HealthLake almacén de datos
Este es un ejemplo de nota clínica basada en el encuentro de un paciente con un profesional médico.
Datos sintéticos
El texto de este ejemplo es contenido sintético y no contiene información de salud personal (PHI).
1991-08-31 # Chief Complaint - Headache - Sinus Pain - Nasal Congestion - Sore Throat - Pain with Bright Lights - Nasal Discharge - Cough # History of Present Illness Jerónimo599 is a 4 month-old non-hispanic white male. # Social History Patient has never smoked. Patient comes from a middle socioeconomic background. Patient currently has Aetna. # Allergies No Known Allergies. # Medications No Active Medications. # Assessment and Plan Patient is presenting with bee venom (substance), mold (organism), house dust mite (organism), animal dander (substance), grass pollen (substance), tree pollen (substance), lisinopril, sulfamethoxazole / trimethoprim, fish (substance). ## Plan The patient was prescribed the following medications: - astemizole 10 mg oral tablet - nda020800 0.3 ml epinephrine 1 mg/ml auto-injector The patient was placed on a careplan: - self-care interventions (procedure)
Como recordatorio, esta información está codificada en formato base64 en el DocumentReference recurso. Cuando haya ingerido este documento HealthLake y se hayan completado API las operaciones de Amazon Comprehend Medical, para ver los resultados, puede empezar con la GET
solicitud del tipo de recurso. DocumentReference
GET https://https://healthlake.
your-region
.amazonaws.com/datastore/your-datastore-id
/r4/eeb8005725ae22b35b4edbdc68cf2dfd
/r4/DocumentReference
Cuando las operaciones de Amazon Comprehend API Medical tengan éxito, busque estos pares clave-valor dentro extension
del enlace a lo siguiente "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/"
{ "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/status/", "valueString": "SUCCESS" }, { "url": "http://healthlake.amazonaws.com/aws-cm/message/", "valueString": "The Amazon HealthLake integrated medical NLP operation was successful." }
Las siguientes pestañas muestran cómo se registra la historia clínica ingresada en su almacén de HealthLake datos en función del tipo de recurso.
Ejemplo 2: Una DocumentReference
que contiene un tipo MedicationStatement de recurso
Este es un ejemplo de una nota clínica basada en el encuentro de un paciente con un profesional médico.
Datos sintéticos
El texto de este ejemplo es contenido sintético y no contiene información de salud personal (PHI).
Tom is not prescribed Advil
En las siguientes pestañas, se muestra cómo se registra el registro médico ingerido en el almacén de HealthLake datos en función del tipo de recurso.