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# Realice una proyección virtual con AutoDock Vina en Deadline Cloud
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El paquete de tareas [https://github.com/aws-deadline/deadline-cloud-samples/tree/mainline/job_bundles/virtual_screening_vina](https://github.com/aws-deadline/deadline-cloud-samples/tree/mainline/job_bundles/virtual_screening_vina) utiliza Vina para analizar grandes bibliotecas de compuestos comparándolas con una proteína diana. El paquete divide una biblioteca compuesta en fragmentos y los acopla en paralelo entre una flota de trabajadores, luego agrega y clasifica los resultados por afinidad de unión.

La canalización consta de cuatro pasos:

1. **PrepareReceptor**— Convierte la proteína PDB al formato PDBQT con Open Babel.

1. **SplitLibrary**— Divide la biblioteca de compuestos del SDF en N fragmentos.

1. **DockCompounds**— Ejecuta N tareas de acoplamiento en paralelo (una por fragmento). Cada tarea es idempotente y segura para Spot Preemption.

1. **ScoreAndRank**— Agrega todos los resultados fragmentados en un CSV clasificado con los mejores éxitos.

El paquete requiere una flota Linux x86\_64 gestionada por servicios (se recomienda Spot), un entorno de colas conda con from y Vina. `openbabel` `conda-forge` AutoDock Instale Vina incorporando la receta de [Cree un paquete AutoDock Vina conda para Deadline Cloud](examples-conda-autodock-vina.md) conda en su canal S3 o instalando el binario mediante un script de configuración de host de flota.

Configúrelo `CompoundLibrary=chembl` (predeterminado) para descargar y filtrar automáticamente moléculas similares a fármacos de [ChEMBL](https://www.ebi.ac.uk/chembl/), o proporcione su propio archivo SDF.

Desde el `job_bundles` directorio, envíe el trabajo:

```
deadline bundle submit virtual_screening_vina \
  -p "ReceptorPdb=receptor.pdb" \
  -p "CompoundLibrary=chembl" \
  -p "MaxCompounds=100000" \
  -p "CompoundsPerChunk=100" \
  -p "CenterX=-10.7" \
  -p "CenterY=12.4" \
  -p "CenterZ=68.8"
```

Para obtener más información sobre la creación del paquete AutoDock Vina conda, consulte[Cree un paquete AutoDock Vina conda para Deadline Cloud](examples-conda-autodock-vina.md).